La Región Amazónica alberga la selva tropical más grande del mundo. Aquí se encuentran al menos 21 ecosistemas acuáticos para las cuatro macrozonas definidas en la región: Altos andes amazónicos, Piedemonte amazónico, Tierras bajas y Transición amazónico-orinocense. Esta zona constituye la región más grande de Ecuador.
La Región Amazónica contiene más del 20% de plantas vasculares o cormofitas (plantas que cuentan con diferenciación entre raíz, tallo y hojas) de la Tierra. En esta zona podemos encontrar al pequeñísimo mono tití pigmeo que mide entre 14 y 18 cm, al sapo gigante (rhinella marina) con un peso 3.5 kg y a la serpiente más grande del mundo, la anaconda.
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